Epi Info permet de réaliser des analyses de survie en appliquant notamment le modèle de Cox à Risques Proportionnels, avec la commande COXPH du module d’analyse des données.

    Or en testant ce type d’analyse, je me suis rendu compte que, par rapport à Epi Info 3.5, dans Epi Info 7 cette commande a été restreinte:

dans la fenêtre qui s’ouvre lorsque l’on clique sur la commande de statistiques avancées “Modèle de Cox à Risques Proportionnels”, le bouton [Options] permettant de sélectionner le type de graphique à représenter, et le bouton [Créer une variable dépendante du temps] permettant d’appliquer le modèle de Cox étendu ne sont pas activés.

Fenêtre "Modèle de Cox à Risques Proportionnels" dans Epi Info 7 (à gauche) et dans Epi Info 3.5 (à droite):

Options des graphiques:

ainsi avec Epi Info 7, il n’est plus possible de sélectionner le type de courbes de survie à représenter, seule l’option par défaut, la courbe de la fonction de survie S (la probabilité de survie) en fonction du temps est disponible.

Fenêtre des Options de graphiques d’Epi Info 3.5, n’apparaissant plus dans Epi Info 7:

Article publié le 4 avril 2014

    Le bureau d’aide d’Epi Info (Epi Info Help Desk) suggère, si on veut appliquer un modèle de Cox étendu avec Epi Info 7, de reprendre la syntaxe de la commande COXPH qui apparait dans l’éditeur de programme, lorsqu’on applique un modèle de Cox à Risques Proportionnels, et d’ajouter “à la main” la syntaxe de création de la variable dépendante du temps désirée, à la suite du nom de cette variable entre deux :.

Fenêtre "Edituer de programme" avec la commande COXPH dans Epi Info 7:

La fonction de survie, seul type de courbe de survie disponible dans Epi Info 7:

Dans Epi Info 7 on ne peut donc plus, pour l’instand représenter par exemple la courbe Log-Log Survie, comme dans Epi 3.5, courbe qui permet de visualiser l’hypotèse de proportionnalité des risques.

Exemple de courbe Log-Log Survie dans Epi Info 3.5:

Fonction Créer une variable dépendante du temps :

de même avec Epi Info 7, il n’est plus possible, à partir de la fenêtre du modèle de Cox à Risques Proportionnels,  de définir une variable explicative dépendante du temps pour appliquer un modèle de Cox à Risques Proportionnels étendu.

Fenêtre création d’une variable dépendante du temps d’Epi Info 3.5, n’apparaissant plus dans Epi Info 7:

    Pour l’instand donc Epi Info 7 avec cette commande COXPH, présente une régression par rapport à la version antérieure Epi Info 3.5, et le bureau d’aide d’Epi Info ne précise pas quand ces deux fonctions seront réimplémentées.

Ajout de la création d’une variable dépendante du temps (la variable sexe) dans la syntaxe de la commande COXPH précédente: